呼和浩特清真大寺位於呼和浩特市舊城通道南街東側。是呼和浩特市建築年代最早、規模最大的一座清真寺，故此得名清真大寺。 
寺門西向，面闊3間，歇山頂宮殿式，前有廊簷，正門上懸「清真大寺」橫匾，兩側開有便門。進人正門面對禮拜大殿後壁。主體建築禮拜大殿為中國傳統建築形式，面闊5間，中為殿門，兩側4間裝雕欞方窗。殿頂層次分明。勾連搭相接，數個贊尖式頂閣既。加殿內采光，又增其精巧美觀。大殿共25間，可容500人同時禮拜。殿前兩側為講堂。東面原為穿堂過廳，現改為接待廳。寺後院坐北朝南為沐浴室，西南角聳立四層六稜體望月樓，為該寺獨有特色建築，六面牆體窗戶隔層裝置，成間隔變化，頂部為六角攢尖頂式，內登樓遠眺，呼市風景盡收眼底。寺院整體建築以中國傳統建築為主，兼容回族磚雕及伊斯蘭教裝飾藝術，佈局工整，莊嚴肅穆。
寺內存康熙三十三年勒石《重到洪武御制回輝教百字碑》（碑文與《天方典禮》等書著錄百字贊有出人）、《康熙聖諭碑》、4重修綏遠清真大寺碑》等碑石7通，阿拉伯文手抄本《古蘭經》30卷，匾額多方。