四川臥龍大熊貓自然保護區位於汶川縣境內，包括臥龍、耿達兩個鄉，是省政府直轄的一個特區。該區總面積約70萬公頃，臥龍保護區處於邛崍山脈東麓，青藏高原向四川盆地過渡地帶的高山峽谷區，5000公尺以上的高山就有101座，最高峰四姑娘山海拔6250公尺。溝內最低海拔1150m，相對高差5,100公尺。這裡峰巒重疊、雲霧繚繞，原始森林、次生灌木林、箭竹林鬱鬱蔥蔥。保護區內有各種植物三、四千種，有四川紅杉，金錢槭等珍貴植物；有各種獸類50多種，鳥類300多種，屬國家保護的珍貴動物就達29種。
保護區始建於1963年，面積20萬公頃，是中國最早建立的綜合性國家級保護區之一，是國家和四川省命名的「科普教育基地」、「愛國主義教育基地」。保護區現有人口5343人，其中，農業人口4550人。1980年，保護區加入聯合國教科文組織「人與生物圈」保護區網，並與世界野生生物基金會合作建立中國保護大熊貓研究中心。1983年3月經國務院批准，將臥龍保護區內汶川縣的臥龍、耿達兩個公社劃定為汶川縣臥龍特別行政區。同年7月，省政府、原林業部聯合作出了將四川省汶川縣臥龍特別行政區改為四川省汶川臥龍特別行政區的決定，與臥龍自然保護區管理局合署辦公的綜合管理體制。臥龍自然保護區以「熊貓之鄉」、「寶貴的生物基因庫」、「天然動植物園」響譽中外，有著豐富的動植物資源和礦產資源。區內共分佈著100多隻大熊貓，約佔中國全國總數的10%。被列為國家級重點保護的其它珍稀瀕危動物金絲猴、羚牛等共有56種，其中屬於國家一級重點保護的野生動物共有12種，二類保護動物44種。據統計區內其它動物種類如：脊椎動物有450種，其中獸類103種，鳥類283種，兩棲類21種，爬行類25種，魚類18種；昆蟲約1700種。據已採集的植物標本統計，區內植物有近4000種。高等植物1989種，在種子植物中，裸子植物20種，被子植物1604種。被列為國家級保護的珍貴瀕危植物達24種，其中一級保護植物有珙桐、連香樹、水清樹，二級保護植物9種，三級保護植物13種。保護區內還有豐富的水能蘊藏量。