馬達巴是古代摩押王國的一部分。在聖經時代被稱為米底巴（Medeba），曾經一度被以色列人所征服（民21:30），但是後來米沙，這位自行冊封的摩押國王，將以色列人驅逐出境並且重建了這城。馬達巴後來被一位猶太人的領袖約翰海爾坎納（John Hyrcanus）統治，然後接下來是那霸天（Nabataeans）王國，最後在主曆106年被羅馬人接管。馬達巴直到第六世紀，一直是一個繁華的基督教城邑，有自己的主教進駐在此。第八世紀開始，這裡逐漸地衰退；數百年以後，滿美露（Mamluks）時期時，這城完全被遺棄。十九世紀末，一些從克臘克遷移而來的基督教家庭重新在馬達巴安頓下來，他們在這裡發現了大量的、無與倫比的拜占庭時代馬賽克鑲嵌畫，包括最有名的一幅古代聖地地圖。