哈密博物館成立於1988年，2002年6月由廣東省人民政府援建的南粵文化中心遷入。博物館有展廳面積800餘平方公尺，庫房面積300平方公尺。館內收藏有原始社會至明清時期的石器、青銅器、陶器、木器、鐵器、毛布、清代服飾和乾屍等文物12000餘件，其中17（類）件為國家一級文物。
文物以通史陳列的方式分為石器時代、青銅時代、漢—北朝及隋、唐、元、明、清來呈現哈密悠久的古代文明，在通史陳列中還包括有獨特文化面貌的五堡、焉不拉克兩個專題陳列。展廳陳列各類文物1000餘件，有轟動國內外的五堡乾屍、精美的古代毛布和屬於北方青銅文化的銅釜、鹿首銅刀等珍貴文物，大部分展品為歷年考古發掘出土文物，有著濃郁的地方文化特色。博物館的陳列設計現已全面更新，處於全疆地州級博物館一流水平。