由地下2層、地上2層組成。設有策劃展室、常設展室、劇場、創作體驗工作房、社區畫廊、咖啡館、商店等。建築物採用了大膽的創意，設計成「在遺跡發掘現場似的巨大土溝上覆蓋著的凸凹有致的白色構造體」。土牆和白牆創造出表情豐富的展示空間，營造了與三內丸山遺跡融為一體的設計形象。而基於「收集美術作品要重視緊密結合地區和風土特點，同時能夠培養豐富的感性，以供未來的創造」這個理念，許多鄉土作品的作品都能在常設展看到，如：棟方志功、關野準一郎、齊藤義重、小野忠弘、鷹山宇一、工藤甲人、工藤哲巳、寺山修二、成田亨、奈良美智等作家的個性豐富的作品。此外，還收集了荒川修作、今井俊滿等國內作家、畢加索、馬蒂斯等國外作家的作品。