長崎原爆資料館坐落於一個當時被原子彈炸毀的教堂之上，教堂僅僅剩下一面牆，至今，你依然可以看到一面被衝擊波毀壞變形的時鐘掛在牆上，時針停止在11點02分，原子彈落下的剎那。原爆資料館的建立初衷很簡單，為了不忘記過去的悲傷，為了激勵前行的鬥志。展館系統的介紹了長崎被原爆毀於一旦之後到如今發展的復興近況，從中你可以瞭解原子彈和戰爭的毀滅之大，可以瞭解長崎人從悲痛中堅強不息的生存精神。
這裡主要分為2個展區，一是特別展出被原子彈毀壞的所有倖存物件，小到一粒碳化的米粒，大到擠壓歪斜的自行車，它們的所有狀態都是見證悲劇的最好證明。另一處展館展現著原爆後期的深遠影響，陳列的照片中有被輻射後發生病變的人們，有匍匐於臭水坑中河水的孩童，還有泡在福爾馬林中畸形的嬰兒。這些鮮活的案例無一不透露著戰爭的殘酷，相信在此能夠有所感悟，有所審視吧。