博爾基亞清真寺，是以現任29世蘇丹蘇丹·哈桑納爾·博爾基亞名字命名的，是由他個人捐資建造的，作為他48歲生日送給臣民的禮物。於1994年蘇丹生日那天正式落成啟用，被當地人稱為「國王的清真寺」。
這座清真寺由主體建築和四個尖頂圓塔組成，主體圓頂與配塔圓頂均用24K純金製成，耗金2.4噸。主體拱頂是耗費黃金最多的部分，也是最能顯示該寺皇室氣派的部分。拱頂的內部飾有色彩艷麗的玻璃，既有裝飾作用，又有采光之功用，明媚的陽光透過玻璃顯得絢爛無比。
清真寺的29個金碧輝煌的小圓頂是為了紀念歷史上29個蘇丹統治的朝代，4座57米高的塔尖裝飾著藍色和白色的馬賽克，高高矗立，既肅穆又華麗。整座清真寺建築用料全部從國外進口，極其考究，從熠熠發光的燈飾到光潔可鑒的大理石地面，到處都散發著具有濃郁汶萊特色的伊斯蘭氣息。