小門嶼位於西嶼鄉北端，面積僅0.5平方公里左右，與西嶼本島僅隔約二百公尺之小海峽，中間有一小門橋相連，而小門嶼北邊的鯨魚洞，是在跨海大橋通車之後才被發現的風景區。
鯨魚洞位在西嶼鄉漁翁島，柱狀節理的玄武岩海崖，因受東北季風所激起強勁海潮的海蝕作用而形成巨大海蝕洞，前後相通，洞內高約三至四公尺，因岩壁外觀形似一隻座頭鯨的頭部，而海蝕拱門的位置剛好襯出鯨魚眼，就像擱淺海灘的鯨魚，大家可以來這邊看看這隻苦命的鯨魚永遠都在這裡賣力的游，真不知牠到底遊了多少數不盡的春秋，牠始終都還在原地掙扎，在洞中還可以聽海濤怒吼。

古老相傳繪聲繪影的傳說故事：
在某一次強風巨浪的夜晚，海中出現一條母鯨魚不小心撞向北岸突出的岩壁，將原本就有些鬆動的節理柱狀玄武岩撞了個大洞，而形成如今之模樣，而和這隻糊塗的母鯨一起同游的兩隻幼鯨不肯離去，徘徊在附近海域嗚嗚哀鳴，村民看了不忍，集合全村眾人之力，合力將母鯨推入海中，然而這兩隻癡心的幼鯨仍在幾天後，可能因體力透支，而擱淺在岩壁岸邊死去．村民因此稱此洞為鯨魚洞。